Na de dood van Saizou, Kabamaru's vreselijk strenge grootvader en iga ninja-sensei (leraar), beweert een oude dame Ran Akoko dat ze een brief van hem heeft ontvangen waarin hij haar vraagt om voor zijn kleinzoon te zorgen. Dus Kabamaru rent met Lady Akoko weg naar de grote stad Tokio om zich te vergapen aan yakisoba, Ramen, chow-mein en naar een gewone school te gaan die eigen vreemde eigenaardigheden blijkt te hebben.
