Агент ФБР Оливия Данэм расследует гибель всех пассажиров авиарейса следующего из Гамбурга в Бостон. В ходе расследования ранен её напарник Джон Скотт, каким-то странным ранением, с которым никто из врачей не сталкивались. В отчаянии Оливия понимает, что ей может помочь доктор Уолтер Бишоп, которого считали безумным учёным и теперь он находится в психиатрической лечебнице. Поговорить с ним можно только при участии одного из его родственников, но у него их не осталось, кроме его единственного сына Питера. Питер оказался преступником, который сейчас в розыске, но несмотря на это Оливия уговаривает его. Уолтера выписывает сын. После Уолтер требует свою бывшую лабораторию и корову. Помощница Оливии Острид привозит корову. Наконец Уолтер соглашается помочь. Оливия продолжает расследование и знакомится с Ниной Шарп, влиятельным руководителем корпорации «Мэссив Дайнемик». Оливия, Питер и доктор Бишоп вместе начнут раскрывать тайну рейса 627. Они соединяют разум Оливии и Джона Скотта, чтобы узнать виновника рейса 627, который и ранил Джона Скотта. Но позже Оливия узнает, что Джон оказался предателем и убил виновника гибели рейса 627. Джон сделает попытку сбежать. Оливия пускается в погоню. Джон Скотт попадает в аварию и погибает. Оливия, Питер и доктор Бишоп сделают первый шаг на пути к осознанию истины, которая находится за гранью нашего понимания.
