A história do anime vai decorrer num mundo onde a humanidade perdeu o controle dos mares. As ameaças que tomaram as águas são um grupo conhecido por "Frota de Alto Mar". Os únicos capazes de enfrentar essa ameça, são as "Kan-Musume" (literalmente, garotas navio de guerra), que são garotas que possuem o espírito de navios de guerra dos tempos passados.
