Países de todo el mundo formaron una alianza para contrarrestar al enemigo emergente de la humanidad "Neuroi", a quien solo las chicas con poderes especiales podían dar batalla. Sin embargo, el Neuroi nunca apareció. En lugar de pelear, las brujas pasan sus días sin hacer nada. Esta vez, siguiendo no solo la unidad 501, sino también la unidad 502 conocida como "Brave Witches!"
