Действието в шести сезон започва 20 месеца след шокиращия финал на пети сезон, когато Джак Бауър е заловен от агенти на китайското правителство и е отведен в неизвестна посока. Уейн Палмър, брат на покойния президент Дейвид Палмър, сега е президент на Съединените щати, а сестра му Сандра Палмър, влиятелен адвокат, му помага. След серия от ужасяващи терористични атаки Палмър и съветниците му Карен Хейс и Томас Ленъкс, заедно с колегите на Бауър – Клои О`Брайън, Къртис Манинг (Роджър Крос) и Бил Бюкенън започват поредния си невероятен и напрегнат ден.
